PROTEO 3.2.2 – Initiation pratique à la spectrométrie de masse en tandem
- Prochaine édition : les 30 et 31 octobre 2024
Présentation
Cette formation offre une expérience pratique complète de la spectrométrie de masse en tandem, permettant aux participants de suivre l’ensemble du processus, de la préparation des échantillons protéiques à l’identification des protéines. Le programme comprend la préparation des échantillons, l’introduction aux modes d’acquisition de données dépendants et indépendants (MS/MS, SWATH), et l’analyse de mélanges protéiques par spectrométrie de masse couplée à l’UPLC. Les participants apprendront à automatiser les analyses, interpréter les spectres de fragmentation, et utiliser des outils bioinformatiques pour identifier et quantifier des protéines, tout en évaluant de manière critique les résultats obtenus.
Programme
- Préparation / pré-traitement des échantillons protéiques (digestion par protéase, …)
- Introduction à l’acquisition des données en mode dépendant et indépendant (MS/MS, SWATH) > démonstration
- Analyse des échantillons (mélange protéique) par spectrométrie de masse en tandem
- Séparation des peptides par UPLC
- Couplage de l’UPLC avec le spectromètre de masse et automatisation des analyses
- Analyse en ligne des peptides élués par spectrométrie de masse en tandem (Q-ToF et Ion Trap)
- Analyse des spectres de fragmentation obtenus
- Analyses bioinformatiques afin d’identifier une protéine à partir des spectres de fragmentation obtenus > discussion critique des résultats obtenus
- Quantification de protéines à partir d’un mélange complexe > discussion critique des résultats obtenus
- Mise en place de méthodes de validation ciblées
Méthodologie
Objectif
- Retracer le cheminement complet d’une expérience de spectrométrie de masse en tandem, de la préparation d’échantillons à l’identification de protéines
Equipe pédagogique
Intervenants
Spécialistes du Service de Protéomie et Microbiologie de l’UMons :
- Baptiste LEROY
PhD et chef de travaux - Tania KARASIEWICZ
PostDoc - Ruddy WATTIEZ
Chef de Service et Vice-Recteur à la Recherche, à l’Innovation et à l’Entreprenariat
- Baptiste LEROY
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Horaire
- 2 jours de formation : 23 et 24 octobre 2024
- De 9h15 à 17h00
Lieu
Sur le campus de l’UMons
Admission
Pour qui
- Travailleurs du secteur biotechnologique : responsables de projet, techniciens de laboratoire, biotechnologues, chercheurs…
- Enseignants des Hautes Ecoles
Pré-requis
- Connaissances de base sur la spectrométrie de masse et l’HPLC/UPLC
- OU avoir suivi les modules
Tarifs
Tarif plein :
- 760€
Tarif réduit (-30%) pour institutions publiques, académiques & ASBL :
- 532€
Tarif réduit (-50%) pour doctorants / techniciens de laboratoire & instit. hospitalières ULB :
- 380€
Je m'inscris
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Contact
Garance VERMEYLEN
02 555 85 17
helsci@ulb.be
F.A.Q
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